由程序框图知：第一次运行f（1）=cos
π
3=
1
2，S=0+
1
2．n=1+1=2；
第二次运行f（2）=cos
2π
3=-
1
2，S=
1
2，n=2+1=3，
第三次运行f（3）=cosπ=-1，S=
1
2，n=3+1=4，
第四次运行f（4）=cos
4π
3=-
1
2，S=
1
2，n=4+1=5，
第五次运行f（5）=cos
5π
3=
1
2，S=1，n=6，
第六次运行f（6）=cos2π=1，S=2，n=7，
…
直到n=2016时，程序运行终止，
∵函数y=cos
nπ
3是以6为周期的周期函数，2015=6×335+5，
又f（2016）=cos336π=cos（2π×138）=1，
∴若程序运行2016次时，输出S=2×336=672，
∴程序运行2015次时，输出S=336×2-1=671．
故选：C．
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