解题思路：求出复数z的实部等于0的x的值，虚部不等于0的x的值，就是使复数z=（x2-9）+（x-3）i是纯虚数的x的值．
令x2-9，解得x=-3，x=3；
令x-3，解得x=3，
所以复数z=（x2-9）+（x-3）i为纯虚数，
则x=-3时，复数z是纯虚数．
故选：A．
点评：
本题考点： 复数代数形式的乘除运算．
考点点评： 本题考查了复数的基本概念，解答此题的关键在于学生对基本概念的理解与把握，此题是基础题．
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