1.你需要知道琼脂糖胶的分辨率是有限的,通常用的1%的琼脂糖胶是不能有效分辨相差100bp以内的片段的（这一点不能说明你的问题）；2.你还需要知道基因组是很大的,通常都是以M为单位的,而琼脂糖胶分辨最大片段的能力是有限的,即便是0.3%的琼脂糖胶所能分辨的最大片段也只有50000bp（这点可解答你的问题）,所以不同长度的染色体DNA是不能在琼脂糖胶上分开的.
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