这个要看研究的对象,拿研究最多的肠道微生物来说,一般16SrDNA测序为2W-4W条reads(454的话长度大概在平均500多,MISEQ平台为400多或者500多bp),关注区域为V3-v4区.环境微生物的,一般reads数也大概这么多.
做完测序的时候会做丰度分析,可以看出来你测序的数据量是否满足你研究.
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