排阻色谱的分辨率是很低的.不知道你的样品是不是蛋白质、多肽类的?如果是的话,一般都在280nm检测,灵敏度也不算高,这是一方面.对一根柱子来说,排阻的分子量有一个范围,看起来很宽,但对大分子物质来说,其实不然,超出范围的要么保留低,要么不容易洗下来.比如脑蛋白水解物,用PROTEIN 60的柱子(Waters)分离,也就3-4个峰,当然这些峰都是混合物.
另外,相信你也明白,排阻依据的不仅仅是分子量,分子形状(次级结构)影响也很大.
再有,色谱条件的影响也不容忽视,你会发现柱子很容易被污染,同一个样品,第2次就可能出个新的肩峰;洗脱情况对流动相的盐浓度、离子强度、pH的变化也很敏感.
这是一点体会了,共参考.
如果要想得到更多的样品信息,有两个建议:一是做HPCE,二是做RP-HPLC