that引导的是一个定语从句,先行词是ways.
has not been identified意思是还没有别鉴定,从句中缺少主语,因此that在从句中作主语.
应该用have,因为主语是复数形式,主谓一致嘛、
这句话的意思是 也许他们很危险,会用一些未经鉴定的方法影响到（或者作用于）生物.organisms翻译成生物比较好
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