解题思路：设这两种实验都做对的有x人，根据九（3）班的50名同学进行物理、化学两种实验测试，经最后统计知：物理实验做对的有40人，化学实验做对的有31人，两种实验都做错的有4人可列方程求解．
设这两种实验都做对的有x人，
（40-x）+（31-x）+x+4=50，
x=25．
故都做对的有25人．
故选C．
点评：
本题考点： 一元一次方程的应用．
考点点评： 本题考查理解题意的能力，关键是以人数做为等量关系列方程求解．
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