解题思路：叶绿体具有双层膜，内含有基粒和基质，光反应在类囊体薄膜上进行，暗反应在基质中进行．
A、增加光合作用面积的方式是：通过由类囊体堆叠而成的基粒来增大光合作用面积，A错误；
B、细胞生物膜系统是指由细胞膜、细胞核膜以及各种细胞器膜围绕而成的，B正确；
C、暗反应在基质中进行，基质中含有与暗反应有关的酶，C正确；
D、还原三碳化合物需要ATP提供能量，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 叶绿体结构及色素的分布和作用．
考点点评： 本题要求考生熟记叶绿体的结构与功能．
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