带有极性,无电荷(亲水的)侧链的氨基酸含有中性,极性基团(极性基团处在疏水氨基酸和带电荷的氨基酸之间)能够与适合的分子例如水形成氢键.丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸的极性与它们所含的羟基有关,天冬酰胺,谷氨酰胺的极性同其酰胺基有关.而半胱氨酸则因含有巯基,所以属于极性氨基酸,甘氨酸有时也属于此类氨基酸.其中半胱氨酸和酪氨酸是这一类中具有最大极性基团的氨基酸,因为在pH值接近中性时,巯基和酚基可以产生部分电离.在蛋白质中,半胱氨酸通常以氧化态的形式存在,即胱氨酸.当两个半胱氨酸分子的巯基氧化时便形成一个二硫交联键,生成胱氨酸.天冬酰胺和谷氨酰胺在有酸或碱存在下容易水解并生成天冬氨酸和谷氨酸
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