三目显微镜较双目显微镜多出一目,也就是多出一条光路来,这样的我们通常就叫三目,目的就是用ccd或者cmos系统把图像取到电脑屏幕上观察,用于摄影拍照只用.
较高档的三目显微镜采用100%的光路切换装置（摄影时目镜不能观察,双目观察时不能摄影）,低档一点的采用5分5的半透半反光路（摄影和双目观察同步进行）.前者优点成像清晰不存在牺牲亮度和半透反光镜带来的干扰；后者优点结构简单.
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