B
A、分子在化学变化中是可以再分的；故A不正确；
B、化合物的定义：有两种或两种以上元素组成的纯净物，所以只含一种元素组成的物质一定不是纯净物；故B正确；
C、生成盐和水的化学反应很多，不一定是中和反应，如非金属氧化物和碱溶液的反应；故C不正确；
D、碳元素有金钢石、石墨、无定形碳等同素异形体．同素异形体由于结构不同，即原子排列不同，彼此间物理性质有差异；但由于是同种元素形成的单质，所以化学性质相似．故D不正确；
故选B
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