解题思路：A、根据原子核的结构进行判断；
B、分子是保持物质化学性质的最小粒子；
C、分子的特性主要有这样4个：“质量小，体积小，总是在不停的运动，彼此间有间隔”；
D、元素的种类由质子数决定，元素的化学性质由最外层电子数决定．
A、原子都是由居于原子中心的原子核和核外电子构成的．故本选项叙述正确；
B、水是水分子构成的，所以能保持水的化学性质的是水分子．故本选项叙述正确；
C、分子与分子之间有间隙．故本选项叙述正确；
D、元素的化学性质是由最外层电子数决定的．故本选项叙述错误；
故选：D．
点评：
本题考点： 原子的定义与构成；核外电子在化学反应中的作用；分子的定义与分子的特性．
考点点评： 本题考查了原子的定义、分子的性质等知识点，属于基础知识，需要熟记．
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