二级结构为三叶草结构,特征为：由四臂、四环组成,已配对的片段称为臂,未配对的称为环.叶炳是氨基酸臂,其上含有CCA-OH3',此结构是接受氨基酸的位置.氨基酸臂对面是反密码子环.在他的中部含有三个相领碱基组成的反密码子,可与mRNA上的密码子互相识别.左环是二氢尿嘧啶环（D环）,它与核糖体的结合有关.右环是假尿嘧啶环（TψC环）,氨基酰-tRNA合成酶的结合有关.在反密码子与假尿嘧啶环之间是可变环,它的大小决定着tRNA分子大的种类.
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