最好不要太低,否则条带不清晰,一般我们会加50~100ng/体系,但是DNA样品实在有限的话可以通过适当提高循环数来得到清晰的条带.
不过模板越少,PCR效果会打折扣的.
还有,模板少,另外其它组分的用量不变的话,引物二聚体会增多,引物非特异性结合的概率会小小增高,当然,最主要的还是影PCR产量.
刚才看了,你是做RAPD,模板少的话条带会比较少的,多态性也不太容易出来,要么你再提DNA,要么你降低退火温度,提高循环数试试
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