A、二者是分子式相同，结构相同，只是书写不同，为同一物质，故A错误；
B、石墨和金刚石是碳元素形成的结构不同的单质，互为同素异形体，故B正确；
C、CH 3OH和HOCH 2CH 2OH含有羟基的数目不同，不是同系物，故C错误；
D、同位素研究对象是原子，H 2、D 2、T 2都是由氢元素组成单质，结构相同，为同一物质，故D错误．
故选：B．
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